早在东汉早期，中医就有“牙痛”的记载：大肠和阳明之脉，是动则病齿痛（《灵枢·经脉》），这是世界关于牙痛的最早记载。根据病因病机不同特点，中医将牙痛分为龋齿牙痛、风热牙痛、风寒牙痛、胃火牙痛、虚火牙痛、寒厥牙痛、瘀血牙痛等七型进行治疗。
玉女煎适用于龋齿引起的牙痛，常用中药如知母、石膏、黄连、生地、丹皮、当归、蜂房、骨碎补、海桐皮、升麻、茄根等。
连翘饮、银翘散、五味消毒饮适用于风热牙痛，牙痛伴见牙龈红肿，不敢咀嚼，得冷痛减，受热则疼痛加重，甚则腮部肿痛的患者，常用中药如连翘、银花、牛蒡子、野菊花、蒲公英、桔梗、当归、赤芍、天花粉、升麻、防风等。
荆防败毒散适用于牙痛伴见怕风寒，患处得热疼痛减轻的风寒牙痛患者，常用中药如荆芥、防风、白芷、细辛、桂枝、藁本、川芎、蜂房、当归等。
清胃散适用于牙齿烧灼样疼痛，伴见牙龈红肿，甚至溃烂流脓，口渴，口臭，大便秘结的胃火牙痛患者，常用中药如石膏、黄芩、生地、丹皮、黄连、升麻、白芷、细辛等。
知柏地黄丸或二阴煎适用于牙齿隐隐作痛，伴见牙根松动，口千，咽干，手脚心发热，夜间盗汗的虚火牙痛患者，常用中药如生熟地、知母、黄柏、山荣萸、山药、茯苓、丹皮、当归、麦冬、地骨皮、白蒺藜、生牡蛎等。
羌活附子汤适用于牙痛牵连至头额，牙龈浮肿，但不充血，得热则疼痛减轻，遇风冷则疼痛加重的寒厥牙痛患者，常用中药如羌活、附子、白芷、防风、升麻、麻黄、黄芪、僵蚕、细辛、革茇、黄柏等。
桃仁承气汤适用于牙痛如锥刺，昼轻夜重，伴见牙龈紫黑或肿起血疱、血瘤的瘀血牙痛患者，常用中药如桃仁、桂枝、芒硝、大黄、生熟地、麦冬、天冬、五灵脂、枳壳、黄芩、茵陈等。
此外，牙痛时可将云南白药粉加热水调成稀糊状，直接涂在龋洞和牙龈上；或取六神丸数粒，置于龋洞中，咬紧即可止痛。